可以。
若借款人在购买第一套房时，也是使用公积金贷款购买的，并且还未完贷款，则在购买第二套房屋时，就不能使用公积金贷款。
若第一套房是用商业贷款买的，并且正在按揭中，则第二套房可以使用公积金贷款。若第一套房的贷款已还清，无论是商业贷款还是公积金贷款，都可以用公积金贷款购买第二套房，相关规定自然也按照第二套来计算。
《住房公积金管理条例》第二条规定，本条例适用于中华人民共和国境内住房公积金的缴存、提取、使用、管理和监督。
本条例所称住房公积金，是指国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体（以下统称单位）及其在职职工缴存的长期住房储金。
第三条规定，职工个人缴存的住房公积金和职工所在单位为职工缴存的住房公积金，属于职工个人所有。