注销企业名下小卖部运营资质的程序大致可分为以下几个步骤：首先，务必确保涉及的税务问题已得到妥善处理，包括所有的欠税及未上报的税务事项应有条不紊地完成处理；
其次，备妥所需之各种证明文件与资料，例如营业执照正本和副本，以及首席执行官（或法定代表人）的身份证件等；
接下来，按照当地政府行政机构的规定，前往登记机关领取注销申请表格，并一并提交所备齐的所有文档资料。
行政机构将根据所提交的各项文件进行严格审核，若无异议，其将批准该项注销申请。

《个体工商户登记管理办法》第十六条
申请个体工商户注销登记，应当提交下列文件：
（一）申请人签署的个体工商户注销登记申请书；
（二）个体工商户营业执照正本及所有副本；
（三）国家工商行政管理总局规定提交的其他文件。