通常来讲，保险公司是会对对方的营运车误工费进行赔偿的。
依据相关的法律规定，当在交通事故发生后，要是由于肇事方的过错使得对方的营运车辆处于停运状态，那么营运方就有权利向肇事方要求赔偿在停运这段期间内的合理损失，这里面就包含了误工费。
在保险公司进行理赔的过程中，一般都会按照相关的法律法规以及保险合同的约定来进行仔细的判断。
倘若保险合同里明确写有营运车辆误工费的赔偿条款，并且事故的责任也在保险的覆盖范围之内，这种情况下，保险公司就应该承担起赔偿的责任。
然而，也会存在一些特殊的情况。
所以，到底是否会进行赔偿以及赔偿的具体金额等相关事宜，都需要根据实际的情况以及保险合同的具体条款来准确地确定。

案情回顾:

小朱驾驶车辆与小李的营运车辆发生碰撞，事故系小朱过错导致小李车辆停运。小李要求小朱赔偿停运期间误工费，小朱的保险公司是否应赔偿误工费成争议点，保险合同对此约定不明。

案情分析:

1、若保险合同中有营运车辆误工费赔偿条款，且事故责任在保险覆盖范围内，按规定保险公司应承担赔偿责任，保障营运方合理损失。
2、本案中保险合同约定不明，需根据实际情况及合同其他条款确定。若被保险人无不符合规定行为，保险公司可能需赔偿；若有相关问题，可能拒绝赔偿。