行政合同行政诉讼民事诉讼的区别有：受案范围不同、诉讼程序不同、诉讼当事人参加诉讼前的身份不同、结案方式不同、赔偿方式不同等；行政合同中的行政诉讼民事诉讼的概念是有一定的重叠的，但是总的来说二者在本质上还是有很大不同的。

《行政诉讼法》第二条
公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。
前款所称行政行为，包括法律、法规、规章授权的组织作出的行政行为。