关于代写协议书双方签字是否有效，需要根据不同情况具体分析，以下为您详细阐述：
一、内容合法且符合表意要求时有效
在现实生活中，很多人可能因为自身书写能力有限或者其他原因，需要他人代写协议书。
当协议书内容不违反法律法规的强制性规定，例如不涉及违法的交易、不违背公序良俗，像不能约定违背公序良俗的不合理条款等。
并且，双方在签字时对协议内容有清晰明确的认知，清楚知晓协议所涉及的各项权利和义务，表意真实。
此时，即使是代写的协议书，也是有效的。
因为代写人仅仅是代笔书写协议内容，关键在于双方当事人的真实意思表示，这种情况下协议能得到法律的认可和保护。
二、存在欺诈、胁迫等情形时可能无效
若一方在签字时受到欺诈，比如被误导关于协议的关键信息；或者受到胁迫，例如被威胁不签字就会遭受人身伤害等；又或者对协议内容存在重大误解，例如误解了协议中的关键条款和责任义务等，导致其并非出于真实自愿的意愿签署协议。
那么，这样的协议可能会被认定为可撤销或无效，无法产生预期的法律效力。
总之，代写协议书本身并不会影响其效力，重点在于协议内容是否合法合规，以及双方签字时是否出于真实意愿。

案情回顾:

小朱请小李代写协议书，双方签字后，小胡认为协议不合理，质疑其效力。争议点在于此代写协议书在双方签字后是否有效，关键要看协议内容及签字时双方表意情况。

案情分析:

1、若协议书内容合法，不违反法律法规强制性规定，且双方对协议内容有清晰认知，表意真实，如不存在违法交易、违背公序良俗等情况，即使是代写，该协议也是有效的，能得到法律认可和保护。
2、若签字时一方存在欺诈、胁迫或重大误解等情形，例如一方被误导关键信息、受威胁或误解关键条款等，并非出于真实自愿签署协议，那么此协议可能被认定为可撤销或无效，无法产生预期法律效力。