若借款人在年末未能按照协议约定归还借款，则债权人有权在法律文件所指定的履行期间的截止日期后两年内提出申请执行。
若该法律文件已明确规定分期偿还义务，那么该期限即是从最后一次偿付期限届满之日开始起算的两年执行申请期。
然而，若是法律文件并没有设定具体的履行期限，那么申请执行的有效期就将从法律文件正式生效之日起开始计算为两年。
在此种情况下，如果债权人因为合理的原因而暂停或者中断执行申请，那么暂停或者中断的时间将不会被纳入到执行申请的期限之内。
因此，债权人应当在上述规定的期限内积极主张权益，例如通过启动诉讼程序或者申请强制执行等方式来维护自身的合法利益。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十条
申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。
前款规定的期间，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从最后一期履行期限届满之日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。