分居期间的个人债务应该由个人独自清偿。分居并不当然导致婚姻关系的消灭，因此分居期间属于个人所借并用于个人消费的债务，由债务方独自偿还，但如果是用于夫妻家庭共同生活所负的债务，则为夫妻共同债务，由夫妻双方共同偿还。

《民法典》第一千零六十四条
夫妻双方共同签名或者夫妻一方事后追认等共同意思表示所负的债务，以及夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的债务，属于夫妻共同债务。
夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义超出家庭日常生活需要所负的债务，不属于夫妻共同债务；但是，债权人能够证明该债务用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示的除外。