依据我国相关法律条款，诽谤罪通过自行协商并签订书面和解协议是具有法律效应的。
诽谤犯罪作为自我诉讼案件的一种，受害者有权自由选择是否向法院提起对加害方的刑事指控。
如果双方能自行相互妥协，经由协商达成和解协议，且原告声明放弃对被告追究刑事责任，此类和解协议在法律层面内将具备等同于原定的约束力。
然而，值得我们注意的是，和解协议的法律效力并非绝对不受条件限制。
若该和解协议是在欺诈、威胁等不正当手段的基础上达成的，或者其内容与法律、行政法规的强制性规定相冲突，那么此份和解协议很有可能被判定为无效。
另外，即便已经达成了和解，倘若诽谤行为所产生的社会影响极其严重，或者涉及到公众利益等重大问题，司法机构仍然可以根据实际情况依法进行处理。
然而，在通常情况下，双方自愿协商并签署的和解协议，确实能够在一定程度上化解纷争，减轻加害方可能承担的法律责任。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十八条
【和解协议的适用范围】下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：
（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；
（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。