施工单位在施工过程中造成房屋损毁的，由施工单位承担赔偿的责任，按造成房屋的实际损失赔偿。
具体如下：
1、赔偿费用一般包括房屋修复费用以及相关的经济损失；
2、如果对房屋造成不可修复的损坏，那么赔偿费用等于原来的房屋价值减去损坏后的房屋价值；
3、如果造成了不可挽回的损失，那么赔偿费用是重置房屋的成本。

《中华人民共和国民法典》第一千一百八十四条
侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。