在涉及遗嘱在前、协议在后的情况时，协议是否有效需要依据具体情形来判定：
一、若协议是遗嘱性质
当协议属于遗嘱性质时，依据《民法典》的相关规定，在存在多份遗嘱且内容相互抵触的情况下，应以最后的遗嘱为准。
这是因为法律尊重立遗嘱人最后的真实意愿表达。
因为随着时间推移，立遗嘱人的想法可能发生了变化，法律认可其最后的决定，所以这种情况下在后的遗嘱性质的协议是有效的。
二、若协议不是遗嘱性质
若协议并非遗嘱性质，例如是一般的民事协议，并且与遗嘱所涉及的内容没有关联。
像双方签订的关于合作经营的协议等，只要该协议符合民事法律行为的有效要件，即行为人具备相应的民事行为能力，能够对自己的行为负责；意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形；不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这份协议就是有效的，其效力与先前遗嘱的效力互不影响。
总之，要准确判断在后协议的效力，关键在于清晰明确协议的性质以及它与遗嘱内容之间的关系。

案情回顾:

小朱生前立遗嘱将房产留给小李，后又签协议。小胡认为协议若为遗嘱性质应取代遗嘱，小丽则认为若协议非遗嘱性质且与遗嘱无关则应各自有效，双方就该协议是否有效产生争议。

案情分析:

1、若协议是遗嘱性质，依据《民法典》，在多份遗嘱内容抵触时以最后的遗嘱为准。因为法律尊重立遗嘱人最后的真实意愿表达，所以这种情况下在后的遗嘱性质的协议有效，会取代先前遗嘱。
2、若协议不是遗嘱性质，如一般民事协议且与遗嘱内容无关联，只要符合民事法律行为有效要件，即行为人有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反强制性规定和公序良俗，协议就有效，与遗嘱效力互不影响。