婚内购房自己写的协议在特定条件下是有效的，具体情况需综合判断。
首先，协议需是双方真实意思的体现。
这意味着夫妻双方在签署协议时，应是在平等、自愿的基础上进行，不存在一方强迫另一方的情况。
同时，协议不能违反法律、行政法规的强制性规定以及公序良俗。
比如，不能约定将房屋归不属于家庭成员的第三人所有，或者约定内容违背社会公德。
其次，协议内容要明确关键信息。
其中，房屋的归属必须清晰，是归一方所有还是双方共有；出资情况也要详细说明，如各自的出资比例、出资方式等。
再者，若有贷款问题，还款责任需明确。
例如，约定由哪一方负责偿还贷款本金和利息等。
若协议明确房屋归一方，另一方放弃产权，双方签字且办理产权登记变更手续，效力更有保障。
但存在欺诈、胁迫等情形时，协议可能无效或可撤销。

案情回顾:

小朱与小李婚内购房后自行签订房屋归属协议，约定房屋归小朱，小李放弃产权。但之后小李称签署时受小朱胁迫，要求认定协议无效，双方就该协议是否有效产生争议。

案情分析:

1、判断协议是否为双方真实意思体现，若小李能提供受胁迫证据，协议可能无效或可撤销；若无法提供，协议可能有效。
2、需审查协议是否违反法律、行政法规强制性规定及公序良俗，若存在此类问题，协议无效。
3、确认协议关键信息是否明确，如房屋归属、出资及贷款还款责任等，若不明确，可能影响协议效力。
4、虽约定房屋归小朱且签字，但未办理产权登记变更手续，协议效力也可能受影响。