当女方怀疑男方有生理疾病却没有确凿证据时，可以从以下几个方面着手处理：
一、积极沟通协商
女方可以选择一个恰当的时机，比如在双方心情都比较平和、氛围融洽的时候，与男方坦诚地交流。
可以用关心的口吻询问男方近期的身体状况，让男方感受到女方的关怀，而非指责。
例如，提及最近是否觉得身体有些不适，是否有去医院做过检查等。
如果男方愿意主动说明情况，那么问题或许就能够得到解决。
若男方愿意配合检查治疗，那更是再好不过，夫妻双方可以共同面对这个问题。
二、留意收集间接证据
在日常生活中，女方要细心留意男方的相关行为表现。
比如，尝试了解男方是否有就医记录，这需要在合法的前提下进行，比如通过查看家庭的医疗费用清单等。
同时，注意观察男方是否在服用特定药物，像一些治疗生理疾病的常用药等。
这些虽然不是直接能够证明男方有生理疾病的证据，但可以作为辅助参考。
三、依法申请医学鉴定
在某些特定情况下，例如涉及到离婚纠纷，并且该疾病对婚姻生活产生了重大影响时，女方可以向法院提出申请，由专业的机构进行医学鉴定。
不过，鉴定需要严格遵循法定程序，要符合相关条件，不能随意进行。
总之，在缺乏证据时，女方应通过合理合法的途径去收集或证实，必要时寻求专业法律帮助。

案情回顾:

小丽怀疑丈夫小胡有生理疾病但无确凿证据，她先尝试与小胡沟通，小胡却不愿谈及。小丽又留意收集间接证据，查看医疗费用清单却发现小胡似乎刻意隐瞒。后因婚姻问题产生纠纷，小丽想申请医学鉴定，小胡却拒绝配合，双方产生争议。

案情分析:

1、小丽与小胡沟通时，小胡不愿说明情况，可能是出于隐私或其他原因，但这不利于问题的解决，夫妻间应坦诚相待。
2、小丽收集间接证据的行为本身并无过错，但需注意在合法前提下进行。小胡的隐瞒行为增加了双方的矛盾。
3、在涉及离婚纠纷且疾病对婚姻有重大影响时，小丽申请医学鉴定是合理的，小胡拒绝配合缺乏合理性，应遵循法定程序解决争议。