其性质迥异。所谓“还建房”，主要是针对这片土地为集体所有的情况，例如在拆迁过程中，往往以某个村庄为整体单位，这些土地并不归属个人名下，而是归集体持有。与之相对应的，“商品房”则是指房地产开发商在购买并获取相应土地使用权后，在此基础上开发建设的住宅楼宇，这类房屋属于私有财产，并非集体资产。
其次，在证件办理方面也有所区别。由于还建房属于集体所有，因此在交付使用之时，无法立即办理两证（即房产证和土地证），需要等待两年甚至更长时间才能取得房产证明；
至于土地证明，除非由村委会相关负责人亲自前往土地管理局，将集体证明分割成若干个个人小证，否则无法单独办理。

《土地管理法》第十条农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理；已经分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组经营、管理；已经属于乡（镇）农民集体所有的，由乡（镇）农村集体经济组织经营、管理。