处理合同纠纷的方法主要包括四个方面：即协商，调解，仲裁以及诉讼。
首先是协商环节：合同各方能够秉承良好的合作精神，以和平友好的方式进行交流与协商，从而妥善地解决纠纷问题，这无疑是最佳的解决方案。
其次是调解环节：若双方在争议问题上无法达成共识，可请求相关机构介入调解，例如，若其中一方或双方均为国有企业，则可申请上级主管部门进行调解。但需注意的是，上级主管部门应在保持公正和中立的立场上对事实真相进行判断并做出调解决定，而非滥用行政权力进行强制干预。
另外，当事人亦有权请求合同管理机关、仲裁机构、法庭等进行调停。
再者是仲裁环节：若合同双方经协商仍无法建立互信关系且无意进行调解，此时便可依据合同中的仲裁条款或在争议发生后达成的仲裁协议向仲裁机构提起仲裁申请。
最后是诉讼环节：若合同中并未明确规定仲裁细则，且事后双方亦未能达成仲裁协议，则合同各方均有权将该合同纠纷提交至法院，借助法律的权威性寻求司法处理。

《民事诉讼法》第一百二十二条
当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。