有效，自建房屋公证是有效的，不过就是做了公证也不能流转到非本集体经济人手中。
如果涉及买卖房屋交易要满足以下要求：
1、房子是合法的
首先发生买卖行为的农村房屋需要是合法的，也就是说买卖公证的农村房子不是违章建筑，房屋产权明确，房屋也没有被有关机构采取查封等的财产保护措施，若是房屋本身就是不合法的，那么其买卖行为也就不是合法的，也就不能进行公证。
2、买卖双方满足一户一宅制度
对于农村房屋的买卖行为而言，买卖双方都需要满足一户一宅的原则，若是买方存在已有农村住宅，或者是有宅基地但却未建房的情况，其再次农村宅基地的行为一般是违反了一户一宅的原则(除非宅基地总面积未超过当地政策要求)，所以其买卖行为将不成立，也就不能进行公证。
《城市房屋权属登记管理办法》第五条房屋权属证书是权利人依法拥有房屋所有权并对房屋行使占有、使用、收益和处分权利的唯一合法凭证。
依法登记的房屋权利受国家法律保护。