关于非法经营罪中对于非法所得金额的认定问题，一般是结合行为人在该非法经营活动中所获取的总收益，然后在此基础上，再扣除非经营所需的日常开支和必要投入。
举个例子来说明，如行为人通过非法销售商品而获得的收益，需要从这笔收入中减去购买原材料以及运输过程中所产生的必要且合理的各项支出。
最终确定非法所得金额时，需重视对相应交易记录、财务账簿、资金流动凭证等资料进行深入研究和分析。

《关于办理非法生产、销售、使用禁止在饲料和动物饮用水中使用的药品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第二条
实施第一条规定的行为，违法所得数额在十万元以上的，属于“情节严重”；违法所得数额在五十万元以上的，属于“情节特别严重”。