恶意信用卡透支案件的刑事立案标准通常包含以下几个要素：
首先，犯罪嫌疑人须出于非法占有的意图，即明知道自己没有足够的还款能力却依然进行大量持卡透支；
其次，其透支金额必须超过了规定的限额或规定的期限；
最后，在经过发卡银行两次催收之后，超过三个月仍然未予偿还。
在此过程中，“非法占有为目的”这一主观因素可能会通过多种形式体现出来，例如肆无忌惮地挥霍透支资金、刻意躲避银行的催收等等。

《中华人民共和国刑法》第一百九十六条
【信用卡诈骗罪、盗窃罪】有下列情形之一，进行信用卡诈骗活动，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产：
(一)使用伪造的信用卡，或者使用以虚假的身份证明骗领的信用卡的；
(二)使用作废的信用卡的；
(三)冒用他人信用卡的；
(四)恶意透支的。
前款所称恶意透支，是指持卡人以非法占有为目的，超过规定限额或者规定期限透支，并且经发卡银行催收后仍不归还的行为。
盗窃信用卡并使用的，依照本法第二百六十四条的规定定罪处罚。