强奸罪的立案标准并并非简单地依据是否存在避孕套这种物品而定。
事实上，对于强奸罪的认定关键在于是否违反了女性的意愿，采用了暴力、恐吓或其他强制手段来强迫与其进行性行为。
因此，避孕套的有无并不具备绝对的影响力，无法作为判断是否应当立案侦查的唯一标准。
在司法实务操作过程中的立案调查，需要对多种证据元素进行综合性的评估和权衡，例如被害者本人的陈述、目击证人的证言、犯罪嫌疑人的供述、现场勘察所得的事实资料以及相关的体检证明等。

《中华人民共和国刑法》第二百三十六条
【强奸罪】以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。
奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；
（四）二人以上轮奸的；
（五）奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；
（六）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。