宅基地上建厂房拆迁是否有补偿，需要根据具体情况来判断，以下为你详细分析：
一、合法建设情况
若在宅基地上建设的厂房经过了相关部门的合法审批，取得了规划许可、建设许可等一系列必要手续，这种情况下在面临拆迁时，通常是会有补偿的。
首先是房屋价值补偿。
相关部门会安排专业的评估机构，对厂房本身的价值进行全面评估。
评估会综合考虑厂房的建筑材料、结构、面积、使用年限等多方面因素，以此确定合理的补偿金额。
其次是停产停业损失补偿。
由于拆迁导致厂房无法正常生产经营，会产生一系列经济损失。
例如预期利润损失，这需要根据厂房以往的经营状况、市场行情等进行估算；还有员工安置费用，包括支付员工的遣散费、再就业培训费用等。
最后还有搬迁安置补偿，用于弥补厂房在搬迁过程中产生的费用。
二、违法建设情况
厂房未经审批，属于违法建筑，按照相关法律规定，可能无法获得全额补偿，甚至没有补偿。
不过在某些特殊情况下，考虑到建设厂房投入的建筑成本等因素，相关部门可能会给予适当的残值补偿。
总之，厂房建设是否符合法律法规及相关审批要求，是决定能否获得拆迁补偿的关键。

案情回顾:

小朱在自家宅基地上建了厂房，后遇拆迁。争议点在于该厂房能否获得拆迁补偿。小朱称建房投入巨大，应获补偿；拆迁方认为厂房未经审批属违建，不应补偿。经查，小朱厂房部分有合法审批手续，部分无手续。

案情分析:

1、对于有合法审批手续部分的厂房，应获得补偿。包括房屋价值补偿，由专业机构综合多因素评估确定金额；停产停业损失补偿，要估算预期利润损失及员工安置费用；还有搬迁安置补偿。
2、对于无合法审批手续的违建部分，按规定可能无法获全额补偿，甚至无补偿，但考虑建筑成本等因素，相关部门可能给予适当残值补偿。