由于各地区经济发展水平和房地产市场行情的差异，导致各地区自建房房屋安全鉴定费用存在差别。
在经济繁荣程度较高的大中城市，房屋安全鉴定费用普遍偏高，这是由其房产平均面积较大及鉴定需求旺盛所决定的，因此，此类城市房屋安全鉴定费用每平米可能在8元至10元之间浮动。
然而，在二线或三线城市，房屋安全鉴定费用则可能在每平米6元至8元之间。
其次，根据鉴定范围的不同，自建房房屋安全鉴定费用亦有所区别。
通常情况下，若仅针对建筑物进行一般的鉴定工作，那么收费标准大约在1000元至2000元之间；若包含结构性鉴定内容，收费标准将上升到2000元至3000元左右；若涉及抗震鉴定，收费标准将会进一步提高，大约在3000元至5000元之间。
此外，鉴定方法的选择也是影响自建房房屋安全鉴定费用的重要因素之一。
常见的房屋安全鉴定方法包括目测法、实测法、敲击法、红外线法以及射线法等多种方式，每种方法的收费标准均不相同。
在部分地区，当地政府机构会提供免费的目测法鉴定服务，但对于其他鉴定方法，则需另行支付相应的费用。

《房屋登记办法》第八十六条
房屋所有权依法发生转移，申请房屋所有权转移登记的，应当提交下列材料：
(一)登记申请书；
(二)申请人的身份证明；
(三)房屋所有权证书；
(四)宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
(五)证明房屋所有权发生转移的材料；
(六)其他必要材料。
申请村民住房所有权转移登记的，还应当提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。
农村集体经济组织申请房屋所有权转移登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。