假如企业擅自扣除员工薪资，那么这类行为是完全合法的。
因为在双方通过明确沟通并签订了书面合同时，工资条款已作为合同内容得到了明确规定，所以企业无权更改或随意扣除员工的薪酬。
然而，如果发生上述情况，首先应向直属人力资源部门了解为何被扣除工资。
若发现企业有不当操作，或者与相关负责人进行过交涉但没有取得满意结果，请考虑向当地劳工监察机构反馈此类问题。

《劳动法》第五十条工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。《劳动合同法》第三十条用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。