根据法律规定，签署协议时仅仅签名而未进行指纹确认，但只要符合法定义务的生效条件，所签订的协议便具有法律效力。
当合同依据合法程序成立之时即刻生效，当事人采取合同书面形式编制合同时，应当由各方当事人共同签署姓名、盖上公章或留下指印方能使合同成立；如果当事人中的某一方在签字、盖章或者按下指印之前就已经履行了主要责任与义务，且另一方对此表示同意接受之时，该份合同即告成立。
此外，还要注意的是，法定的其他相关情况也可能影响合同的法律效力。

《民法典》第四百九十条
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。