当涉及到两个子女因男方患病而面临离婚问题时，法院通常会从多个方面进行深入分析并依据相关法规，慎重考虑之后再作裁决。
首要的考量因素在于男方的身体状况对他能否持续行使抚养义务的潜在影响。
若男方的健康状况严重到无法承担起抚养责任，那么在做出最终判决时，这一点无疑会被纳入考虑范围之内，并且法院很可能会倾向于将孩子的抚养权交由女方负责。
除此之外，法院还会关注其他诸多因素，例如孩子们的年龄、双方父母的经济状况、抚养能力以及孩子们的个人意愿（特别是对于年满八岁及以上的孩子）。
如果孩子们与父亲之间的亲情纽带较为紧密，同时父亲具备足够的抚养能力，那么法院在做出判决时就有可能会出现不同的结果。
最后，法院会遵循“最有利于未成年人”的原则来做出最终的判决。
这也就意味着，即便男方由于疾病原因无法亲自抚养孩子，但仍可以通过其他途径（比如委托他人代为抚养）来确保孩子们的最大权益得以实现。
总而言之，离婚案件中关于孩子抚养权的判定是一项极为复杂的工作，需要结合实际情况和相关法律法规进行全面考虑后才能得出结论。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。