在分居期间，若男方未经允许擅自将孩子带走，则该行为构成违法行为。
根据相关法律规定，父母双方均负有抚养子女的责任与义务，任何一方的不当行为都可能侵犯到另一方的权益。即使在离婚之后，父母与子女之间的亲子关系并不会因此而终止。在此情况下，女方带走孩子无疑会给对方带来精神上的痛苦和折磨，甚至可定性为一种虐待儿童的行为，对此女方有权采取适当措施维护自身权益，如向警方报案。

《民法典》
第一千零八十四条　父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。