小产权房没有国家发放的土地使用证，购房合同在国土房管局不会给予备案，所谓产权证亦不是真正合法有效的产权证。
根据《房屋登记办法》的规定：
未依法取得规划许可、施工许可或者未按照规划许可的面积等内容建造的建筑申请登记的，房屋登记机构应当不予登记。

《房屋登记办法》第七条
办理房屋登记，一般依照下列程序进行：
（一）申请；
（二）受理；
（三）审核；
（四）记载于登记簿；
（五）发证。
房屋登记机构认为必要时，可以就登记事项进行公告。