1.在通常的情形下，保险公司是不会对停运损失费进行代位追偿的。
停运损失费主要是由于交通事故使得营运车辆被迫停止运营而引发的损失，这类损失属于间接性的损失。
2.在保险理赔的过程里，保险公司一般只会对直接损失给予赔偿，对于间接损失通常是不会进行赔付的。
所谓代位追偿，指的是保险公司在对被保险人完成赔偿之后，依法拥有了向第三者请求赔偿的权利。
3.不过呢，如果在保险合同当中明确规定了停运损失费是可以进行赔偿的，并且也满足保险理赔的相关条件，那么保险公司在实施赔偿之后，是可以进行代位追偿的。
但这通常需要去证明停运损失费的合理性与必要性，同时还要证明是第三方的过错导致了这样的损失。
4.总而言之，一般来说，保险公司不会对停运损失费进行代位追偿，而具体的情况则需要依据保险合同以及实际的状况来进行判断。
案情回顾:
小朱的营运车辆与小李驾驶的车发生交通事故，小朱的车被迫停运产生损失。小朱向自己投保的保险公司索赔停运损失费并要求保险公司代位追偿小李。保险公司以停运损失费为间接损失通常不代位追偿为由拒绝。小朱称保险合同有相关可赔规定。
案情分析:
1、一般而言，停运损失费为间接损失，保险公司通常不对此进行代位追偿。
2、若保险合同明确规定可赔停运损失费且满足理赔条件，保险公司可在赔偿后代位追偿，但需证明损失合理性、必要性及第三方过错。所以需看小朱保险合同的具体规定来判定保险公司的做法是否合理。