对于在交通事故发生后，因保险车辆未能按时进行年度检验而被保险公司拒绝理赔的合理性问题，我们需要针对两种不同情况进行细致分析：
首先，如果被保车辆未能按时年检的事实与保险事故的发生并无直接、必然联系，那么保险公司便不能以该原因作为拒不理赔的理由；
其次，若被保车辆未能按时年检与保险事故的发生存在直接、必然的关联性，那么保险公司有权依据相关法律法规，对事故损失予以拒赔，且无需承担相应的赔偿责任。

《中华人民共和国保险法》第17条“对保险合同中免除保险人责任的条款，保险人在订立合同时应当在投保单、保险单或者其他保险凭证上作出足以引起投保人注意的提示，并对该条款的内容以书面或者口头形式向投保人作出明确说明；未作提示或者明确说明的，该条款不产生效力。”，在投保时，保险公司未对免除赔偿义务的条款进行说明，则该免责条款无效。