关于民事协议的诉讼时效问题，具体情况如下：
1.一般规定：
一般民事协议的诉讼时效是三年。
这三年的起算时间，是从权利人知道或者应当知道自己的权利受到损害，同时也清楚义务人是谁之日开始计算。
比如，甲借给乙钱，约定了还款日期，到期乙不还钱且甲知道这一情况时，诉讼时效就开始计算了。
2.特殊规定：
法律另有规定的，要依照其规定。
例如，国际货物买卖合同和技术进出口合同争议的诉讼时效为四年。
不同类型的协议，诉讼时效可能不同，需根据实际情况确定。
3.时效届满相关情况：
诉讼时效期间届满后，义务人可以提出不履行义务的抗辩。
但如果义务人同意履行，就不能再以诉讼时效期间届满为由进行抗辩；
若义务人已经自愿履行了义务，也不得请求返还。
总之，在涉及民事协议诉讼时效问题时，要准确判断具体情况，依法维护自身权益。

案情回顾:

小朱与小李签订民事借款协议，约定还款日期。到期后小李未还钱，小朱知晓情况但三年后才起诉小李要求还钱，小李以诉讼时效已过进行抗辩，且之后小朱又拿出证据表明小李曾口头答应还钱。争议点在于此借款协议诉讼时效是否已过以及小李能否再以时效抗辩。

案情分析:

1、按照一般规定，民事借款协议诉讼时效为三年，从小朱知道权利受损害且清楚义务人即小李时起算，三年后起诉看似已过时效。
2、但小李曾口头答应还钱，根据规定，义务人同意履行的，不能再以诉讼时效期间届满为由抗辩，所以小李此时不能再以此抗辩。