发生小型医疗事故的，处理如下：
1、可以由双方当事人自行协商解决。协商解决的，应当制作协议书。
2、协商不成的，可以申请向卫生行政部门调解。申请医疗事故争议处理，应当在当事人知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年之内向卫生行政部门提出书面申请。
3、调解不成的，可以向人民法院提起诉讼，解决纠纷问题。

《医疗事故处理条例》第四十三条
医疗事故争议由双方当事人自行协商解决的，医疗机构应当自协商解决之日起7日内向所在地卫生行政部门作出书面报告，并附具协议书。
第三十七条
发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。
当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。