船舶所有权证书不是长期有效的，船舶所有权登记证书有效期是五年，船舶登记机关签发的用以证明船舶的国籍、船籍港、船舶所有权的一种证书。船舶所有人无论是原始或传来取得船舶所有权，都必须在其选择的船籍港向船舶登记机关申请船舶所有权登记。

《中华人民共和国船舶登记办法》第三十九条
船舶国籍证书有效期为5年，但下列情形除外：
（一）老旧运输船舶国籍证书的有效期不得超过船舶强制报废日期；
（二）光船租赁船舶国籍证书的有效期与光船租赁期限相同，但最长不超过5年。