在实际生活中，遇到这种情况通常是这样处理的。
宅基地的所有权牢牢归属于农村集体组织，村民仅仅享有对其的使用权利。
倘若那宅基地上的房屋属于夫妻共同财产范畴，当婚姻走到尽头离婚时，女方在房屋方面的出资部分，就可以当作是对夫妻共同财产的一份贡献。
在对房屋进行分割的时候，就能够把她的出资情况纳入考量，适当地给予女方一定的补偿。
但要是这房屋是男方在婚前就拥有的个人财产，只是女方出资进行了诸如翻建之类的行为，那么在离婚之时，女方就有权利主张对自己出资部分的返还。
而具体该如何分配，那得综合多方面的因素来决定，像出资的比例大小、房屋实际的使用状况等等。
所以，为了避免不必要的麻烦和纷争，最好是双方都尽量通过友好协商的方式来解决问题。
要是实在协商不下来，那就只能向法院提起诉讼，让法院依据具体的实际情况来作出公正的判决。