长期分居后办理离婚手续主要存在以下两种途径。
其一为协议离婚。
当夫妻双方达成一致意见时，便可前往婚姻登记机关办理离婚登记手续。
在此过程中，需要携带诸如身份证、结婚证以及详细的离婚协议书等材料。
办理时，还需经历三十日的离婚冷静期，期满后双方需亲自前往婚姻登记机关申请领取离婚证。
这一方式较为便捷，只要双方能就财产分割、子女抚养等问题达成共识，便可顺利办理离婚。
其二是诉讼离婚。
其中一方可以向被告的住所地或者经常居住地的法院提起离婚诉讼。
法院会依据夫妻之间的感情状况是否确实已经破裂来作出是否准予离婚的判决。
如果因感情不和而分居满二年，并且经过调解依然无效，那么法院应准予离婚。
不过，在诉讼过程中，需要充分提供分居的证据，像分居协议、证人的证言等，这样能增强诉讼请求的说服力，让法院更能准确地判断双方的婚姻状况。
总之，无论是选择协议离婚还是诉讼离婚，都应当严格依据法律规定，并结合自身的实际情况，谨慎地选择合适的离婚方式。