对于房产证纠纷的妥善处理方式：首先，应由相关各方当事人进行协商，如能达成一致意见并且约定具体事宜，应严格遵循此约定；其次，若协商未能达到预期效果，可考虑寻求社区基层组织的协助和调解；再者，纠纷当事人亦有权选择直接向法院提起诉讼；而若在房屋租赁合同中已有明确约定过仲裁事项，相关各方皆可根据合同条款，选择通过仲裁途径解决纠纷。

《中华人民共和国民法典》
第一百八十六条因当事人一方的违约行为，损害对方人身权益、财产权益的，受损害方有权选择请求其承担违约责任或者侵权责任。
第二百三十三条物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
第五百七十七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第五百七十八条当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满前请求其承担违约责任。