在接受认罪认罚制之后，仍然存在被不起诉的可能性。
检察机关对于是否提起公诉的决定将会综合权衡多个案件因素进行评估，这些因素包括但不仅限于犯罪行为的性质、情节严重程度、对社会带来的危害性以及犯罪嫌疑犯在整个过程中的认罪态度和悔过之意。
如果犯罪行径显著降低至微乎其微的地步，对社会危害程度也随之减少，从而无法被认为是犯罪行为的话；
又或者，犯罪行为已经超过了法定的追诉期限；
再者，经过最高统治者颁布特赦命令而免除了该人相应的刑罚；
违反刑法中须由当事人自行起诉或撤回申诉的犯罪，而没有此类诉讼或申诉发生；
最后，倘若犯罪嫌疑人、被告人已经去世；
或者是由于其它法律法规规定而无需承担刑事责任的情况下，检察机关便可根据具体情况作出不起诉的决定。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条
【依法不追诉原则】有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。