1.公诉案件理论上确实是可以达成和解协定的，然而实际操作中需要视具体情况而定；
2.司法实践中能够进行和解处理的案件主要涉及到侵害公民基本人身权利及民主自由方面的罪行以及侵犯财产权益类罪行，且这种罪行可能会面临短暂时间内三年以下有期徒刑的法律制裁；
3.若犯罪嫌疑人家属能够通过赔偿受害者的经济损失、做出诚挚道歉等方式争取受害者的原谅，展示其真心实意的悔过情态，同时受害者愿意主动与之达成和解协议，经过双方协商和同意，此类案件理论上也是可以进行和解处理的。
在此过程中需要注意避免强制性和违反公平公正原则的行动。
对于公诉案件的具体程序来说，首先，通常情形下是由侦查机构受理报案人或者控告人提供的举报信息，也有时侦查机构自身会发现犯罪行为的迹象，进而决定采取立案侦查的措施来查清事实真相；
接下来，当侦查机构完成其任务后（认为罪犯已经构成犯罪），便会向上一级检察机构提出公诉请求，同时必须提交详尽的起诉意见书，并且附上整个案子的所有证据材料；
如果审阅这些证据后，检察机构认为证据足够充分支撑其控诉的话，就会向法院发起公诉；
反之，如果发现证据不足以证明问题的话，他们将会把案件退给侦查机构以要求其进一步搜集和补充相关证据。
之后就是法庭审判阶段了，法院会受理检察机构提出的公诉案件，然后具体分为组织控辩双方对证据进行质证和辩论，听取被告人的详细说明等环节，最后综合考虑所有证据的情况，给出判决结果；
最后一步就是执行判决了，无论最终判定罪犯是有罪还是无罪，只要判定有罪的话，判决都将在生效后交给执行机构进行执行。
这其中包括但不仅限于监狱、看守所、社区、司法所等单位。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百七十七条
下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：
（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；
（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。