对于检察院不起诉是否会对子女有影响，要分两种情况来看。如果犯罪嫌疑人是因为没有违法犯罪事实而让人民检察院决定不起诉的话，就不会有案底，这个情况下是没有影响的。
反之如果不是因为没有违法犯罪事实而被决定不起诉的情况，则依然会有案底记载，并且对子女后续入伍或考司法机关有一定的影响。

《刑事诉讼法》第十六条
有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
(二)犯罪已过追诉时效期限的；
(三)经特赦令免除刑罚的；
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。