依据我国刑法诉讼法规则之第一百七十六条规定，检察机关在确认犯罪嫌疑人涉嫌犯罪事实已被详尽查证清楚，且各项证据确实无误、充足完备，依法律规定应负刑事责任之际，便应当依法作出起诉裁定，进而向人民法院提出公诉。基于以上解读，对于严重侵犯人身权利的强奸罪行，倘若检察院已然明确查实违法犯罪行为的详细过程，并掌握了确凿无疑的证据，那么，依照法律规定，检察院理所当然地应当依法提起公诉。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十六条
人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送人民法院。
犯罪嫌疑人认罪认罚的，人民检察院应当就主刑、附加刑、是否适用缓刑等提出量刑建议，并随案移送认罪认罚具结书等材料。