关于信用卡逾期是否会自动扣除客户在同一金融机构内开立的银行卡中的资金，这需要根据具体情况进行分析：
首先，若涉及到的是由客户个人名义申请并持有之信用卡与借记卡，虽然它们均属于同一金融机构旗下，但却归属不同的业务部门分别进行独立运营和管理。
此时，若客户的信用卡出现长期逾期未还的情况，银行亦有权从该客户在本行开设的储蓄账户中进行相应的资金扣除操作；
其次，若客户在其他金融机构拥有银行卡，那么在这种情况下，银行将无法自动对其进行资金扣除。

《中华人民共和国民法典》第六百七十一条
贷款人未按照约定的日期、数额提供借款，造成借款人损失的，应当赔偿损失。
借款人未按照约定的日期、数额收取借款的，应当按照约定的日期、数额支付利息。
第六百七十四条
借款人应当按照约定的期限支付利息。对支付利息的期限没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定，借款期间不满一年的，应当在返还借款时一并支付；借款期间一年以上的，应当在每届满一年时支付，剩余期间不满一年的，应当在返还借款时一并支付。