通常来讲，交通事故鉴定伤残鉴定被退回来的那些费用，会依照当初缴纳的那个途径给退回去。
具体的流程大概是这样的：第一步，得搞清楚鉴定机构退回费用的依据以及相关的规定。
如果是因为鉴定机构自身的原因而使得鉴定被退回来，那鉴定机构就得负责把费用给退回来。
当事人可以向鉴定机构提出退费的申请，并且得提供相关的缴费凭证之类的材料。
鉴定机构收到申请之后，就会进行审核，要是确认符合退费的条件，就会按照规定的时间和方式把费用退还给当事人，通常会通过原来的支付渠道来退款。
要是碰到特殊的情况，双方可以一起商量着去解决退费的这件事儿。
总而言之，当事人得积极地跟鉴定机构去沟通交流，这样才能更好地维护好自己的合法权益。