当机动车和非机动车负有同等责任时，其赔偿原则通常按照以下流程进行：
首先应从机动车的强制交通意外保险中，按责任承担的上限额，对非机动车一方所遭受的损失进行赔付。
如果超过此限额的情况下，那么保险公司将不承担赔偿责任，需由双方依据各自应承担的责任比例分摊剩余产生的损失。
举例来说，如果非机动车一方所遭受的损失总额为10万元，机动车的强制交通意外保险能够支付的赔偿金额为8万元，那么剩下的2万元则需要由双方各承担50%的责任，即机动车一方还需要额外支付其中的1万元。

《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条
机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照下列规定承担赔偿责任：
（一）机动车之间发生交通事故的，由有过错的一方承担赔偿责任；双方都有过错的，按照各自过错的比例分担责任。
（二）机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人没有过错的，由机动车一方承担赔偿责任；有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任；机动车一方没有过错的，承担不超过百分之十的赔偿责任。
交通事故的损失是由非机动车驾驶人、行人故意碰撞机动车造成的，机动车一方不承担赔偿责任。