若在签订合同时，合同章未能完全加盖，从一般的角度来看，这有可能对合同的法律效力造成影响。
然而，如果能够有力地证明在合同签署过程中，双方的确存在着真实的合意并且在实际操作中完成了合同项下主要义务，那么即便合同章部分缺失，该份合同仍具备一定的效力。
但是请注意，这种情形下合同仍然面临一定程度上的法律风险与不确定性。
为避免日后出现不必要的争议，我们建议您尽快对未加盖完全的合同章进行补充并确保其清晰可辨。

《中华人民共和国民法典》第四百九十条
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。