若房产证逾期申办，违约金应根据签署协议中所设定之标准进行核算。违约金乃双方约定之违约责任承担方式，违约方若已缴纳定金，则依据合同规定须向另一方赔偿相应金额的违约金。如双方于购房合同时即已明确商定违约金的具体额度，则违约方须依据该约定向受损方支付所规定的违约金；若合同仅对违约金支付方式进行规定，而未规定具体额度，那么违约方在违约行为发生之后，需根据合同约定的计算方法得出赔偿数额，然后依照计算出的结果向受损方支付违约金。当违约方支付违约金时，倘若发现违约金款额远远超过实际损失，可向前述仲裁机构或人民法院申请减少违约金，此处所指“远超”是指违约金款额超过损失总额的30%;反之，如收受违约金的一方认为违约金不足以弥补其实际损失，亦有权向前述仲裁机构或人民法院提出申诉，要求增加违约金款额，直到达到与其损失相当的地步。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。