房产纠纷法院调解程序是：调解的主持人由审判人员一人或合议庭共同主持；审判人员查明有争议的案件事实，并在此基础上根据有关法律、法规分清是非责任；将当事人双方经过协商达成的调解协议内容记入笔录，并由双方当事人或经过授权的代理人签名。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百条
调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。
调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。
调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。