关于开发商逾期交付房屋的违约责任计算方式，通常基于购房协议中的具体条款约束。
在此方面主要存在以下两大类计算方法：
首先是确立固定金额作为违约罚金，比如在协议中约定若开发商未能按时交付房屋，则需以每日定额的赔付款项补偿给业主；
其次便是按照业主支付的房款总额的一定比例来计算，例如每日按照业主所支付房款的万分之一或者千分之一的标准来计算违约罚金。
然而，若在协议中并未对违约责任作出明确规定，那么根据相关法律法规以及司法实践经验来看，违约罚金应当基于实际经济损失状况加以考量，并结合协议的执行状况、各方当事人的过失程度以及预期的商业收益等诸多综合因素，最终由法院或仲裁机构依法依规进行核定裁决。
值得强调的是，倘若您遇到了此类问题，请确保妥善保管所有与之相关的重要凭证，比如购房协议原件、开发商发送的有关延期交付的正式通知函件、催告记录等等，以便未来在必要时能够有效维护自身权益。