这个问题需要根据实际情况进行详细分析。
一般的情况下，如果中介公司已经顺利地完成了常规性的、主要的交易促进任务，即使在商品房购买协议发生违反合同时，仍然有可能被主张收取中介费用。
因为在一般的中介服务合同中，它是与房屋买卖契约相对独立的。
一旦中介公司成功地达成双方签署合同的目的，那么他们的义务也基本可以视为已经完成。
然而，当中介服务出现了缺陷，比如未能充分提供相关的房子关键性信息等，如此一来最终导致协议违约，此时就有可能会适当调低或者完全免去中介费用。
另外，如果在正式的合同当中包含了关于违约责任处理中所涉及到的特殊条款，我们会按照这些条款的明确规定来执行。
总的来说，我们需要结合考虑到中介服务完成的整体状况、合同中的既定约定以及引发违约的具体原因等各方面因素，从而全面评估并决定是否支付以及具体应该支付多少中介费用。