为了确保婚后由父母支付的首付款额得到充分保护，可以考虑以下几种方式来维护其应有的利益：
首先，要求子女与其签署借款协议，具体列明该笔款项作为购房首付款；
其次，在购买房产之时，可以通过共同签署协议的方式，明确规定两方对该住房的所有权比例或父母在该住房中所享有的权利和利益，从而保障家长所提供资金的安全性；
最后，可妥善保存所有涉及支付首付款的相关凭证，例如银行转账明细等等。

《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第二十九条
当事人结婚前，父母为双方购置房屋出资的，该出资应当认定为对自己子女个人的赠与，但父母明确表示赠与双方的除外。
当事人结婚后，父母为双方购置房屋出资的，依照约定处理；没有约定或者约定不明确的，按照民法典第一千零六十二条第一款第四项规定的原则处理。