在此种情况下，保险公司应当予以赔偿。由于车辆未进行年度检验而发生交通事故，交强险的保险公司可以履行赔偿义务，但商业保险（如车辆损失险、第三者责任险、车上人员责任险及其附加险等）则无法给予理赔。
根据《机动车第三者责任保险条款》所明确的规定，在车辆未按规定进行年度审查或者年度审查未通过，以及保险车辆并不具备有效行驶证件的其他特定状况下，保险人均无须承担任何形式的赔偿责任。这便意味着，保险合同的规定仅适用于合规且合法的车辆。保险公司在无法对未按期进行年度审查的车辆所导致的交通事故进行赔偿之外，对于车辆丢失的情况亦会拒绝提供赔偿服务。

《保险法》第一百三十一条
投保人、被保险人或者受益人有下列行为之一，进行保险欺诈活动，构成犯罪的，依法追究刑事责任;
(一)投保人故意虚构保险标的，骗取保险金的;
(二)未发生保险事故而谎称发生保险事故的，骗取保险金的;
(三)故意造成财产损失的保险事故，骗取保险金的;
(四)故意造成被保险人死亡、伤残或者疾病等人身保险事故，骗取保险金的;
(五)伪造、变造与保险事故有关的证明、资料和其他证据，或者指使、唆使、收买他人提供虚假证明、资料或者其他证据，编造虚报的事故原因或者夸大损失程度，骗取保险金的。
有前款所列行为之一，情节轻微，不构成犯罪的，依照国家有关规定给予行政处罚。