在这种情况下，保险公司是必须负责理赔的。不过，如果车辆未能及时进行年度检查而导致了意外事故的发生，那么仅能从强制性的交强险中得到理赔，而对于商业保险（如车辆损失险、第三者责任险、车上人员责任险及相关附加险等）则无法享受保障。根据《机动车第三者责任保险条款》的明确规定，当保险车辆在发生交通事故时，若其未按照规定进行年度检验或者检验结果不合格，亦或是该车辆并不具备有效的行驶证件等特殊情况出现时，保险人将不会承担相应的赔偿责任。换言之，保险合同仅对符合标准且合法的车辆生效。除此之外，保险公司还会对未按时进行年度检验的车辆所引发的交通事故不予理赔，同时，对于车辆丢失的情况，保险公司也会予以拒赔。对于那些未参与年度检验的车辆，交警部门有权依据《道路交通安全法》的相关规定，对驾驶员处以200元人民币的罚款，并扣除驾驶证分数3分，同时还需暂时扣留车辆。

《机动车交通事故责任强制保险条款》
第十条投保人在投保时应当选择从事机动车交通事故责任强制保险业务的保险公司，被选择的保险公司不得拒绝或者拖延承保。
国务院保险监督管理机构应当将具备从事机动车交通事故责任强制保险业务资格的保险公司向社会公示。