保密协议的有效期主要依据协议双方的约定来明确，以下为你详细介绍：
1.一般约定情况：通常在1至5年这个区间。
比如一些普通的商业合作项目，若涉及常规的技术信息或客户资料等，双方可能会约定2至3年的保密期限，以保障合作期间及合作结束后一段时间内信息的安全性。
2.未明确约定情况：在合理期限内，一般理解为不超过合同履行期以及合同终止后2至3年。
例如一些短期的服务合同，若未特别约定保密期限，就会参照此标准。
3.特殊情况：从法律角度出发，若涉及商业秘密等重要信息，为充分保护权利人利益，有效期可适当延长。
不过，过长的保密期限会限制信息合理使用，要在保护与利用间寻得平衡。
不同行业、不同类型的保密协议可能有特殊规定。
例如软件行业对源代码的保密要求可能更高。
所以，具体有效期需结合实际情况和相关法律法规确定。

案情回顾:

小朱与小李合作软件项目，签有保密协议但未明确保密期限。项目结束后，小朱在合同终止3年后，将项目涉及的部分源代码用于自己新项目。小李认为小朱违反保密协议，小朱则称协议未约定期限，已过合理保密期，双方产生争议。

案情分析:

1、按未明确约定情况的一般理解，在合理期限内即不超过合同履行期以及合同终止后2至3年。此案件中合同终止已过3年，从常规看小朱似乎未违反。
2、但考虑行业特殊性，软件行业对源代码保密要求高，此涉及商业秘密等重要信息，有效期可适当延长，故小李主张也有一定合理性。