当对交通事故认定书存在异议时，通常还是应该进行签字。
这一签字行为，主要是对已经收到该认定书这一事实的确认，而非意味着对认定书的所有内容都予以认可。
在签完字之后，当事人有三日内申请复核的权利。
申请复核时，必须提交书面的复核申请，并且要详细阐述异议的理由以及相关的证据。
复核机关会对原认定书进行认真的审查，倘若确实存在错误的情况，就会予以纠正。
然而，如果未在规定的时间内申请复核，那么该认定书就会生效。
在后续的诉讼等相关程序中，当事人虽然可以提出证据对认定书进行质证和辩论，但是认定书所具有的效力将会得到较高程度的认可。
总之，签字这一行为是程序上的要求，它并不影响当事人后续享有的复核等权利，这些权利能够有效地保障当事人的合法权益。
通过签字确认收到认定书，再依据规定的时间和程序进行复核等操作，能够更好地维护当事人在交通事故处理过程中的合法权益。

案情回顾:

小朱与小李发生交通事故，交警出具了交通事故认定书。小朱对认定书有异议，但在交警告知签字只是确认收到后签了字。小胡告知小朱可在三日内书面申请复核并阐述理由提交证据。小朱未在意，三日后认定书生效。之后诉讼中小朱再想质疑认定书效力。

案情分析:

1、小朱签字只是确认收到认定书，不代表认可内容，这符合相关规定。
2、小朱未在规定的三日内申请复核，导致认定书生效，在后续诉讼中认定书效力会被较高程度认可，小朱失去了通过复核纠正认定书可能错误的机会。